Juni was een warme maand. Al een jaar lang sluit het KNMI de maand af met ‘warmer dan normaal’, met uitzondering van augustus 2006. Het was een warme, wisselvallige maand met weinig zon. De voorjaarsmaanden maart, april en mei waren alle drie zonniger dan juni. Regelmatig kwamen zware buien voor die tot wateroverlast leidden. Ook onweerde het vaak. Vrijdagavond 8 juni was het zelfs zo erg dat het KNMI hiervoor een weeralarm uitgaf. Met in De Bilt een gemiddelde temperatuur van 17.5 °C tegen 15.2 °C normaal, eindigt juni op een gedeelde vijfde plaats in de rij van warmste junimaanden sinds 1901. De warmste maand in deze lijst was die van 1917 met een gemiddelde temperatuur van 18.3 °C.
Alleen begin juni bracht droog, warm en vrij zonnig weer. Vanaf 8 juni werd het weer sterk wisselvallig maar het bleef warm. Vanaf de 21e daalde de temperatuur naar waarden rond of zelfs iets beneden het langjarige gemiddelde. In De Bilt werden in totaal 23 warme dagen (normaal 12) en 4 zomerse dagen (normaal ook 4). Vrijdag 8 juni was in een groot deel van het land een tropische dag. De landelijk hoogste temperatuur in juni, 31.9 °C, werd die dag genoteerd in Volkel en Ell. Op 27 juni werd in Woensdrecht met 7.4 °C de landelijk laagste temperatuur gemeten. Tot en met de 7e verliep juni op veel plaatsen droog. Daarna viel in delen van het land iedere dag wel enige neerslag. Door het vaak buiige karakter van de neerslag waren de maandommen, zoals wel vaker in een zomermaand, grillig verdeeld over het land. Op 14 juni veroorzaakte een downburst in combinatie met extreem zware regenval aanzienlijke schade in de omgeving van Hoogeveen. Ook op andere plaatsen waren zware buien actief en viel lokaal 50 mm of meer met wederom wateroverlast tot gevolg. Ook op diverse andere dagen vielen lokaal grote hoeveelheden neerslag, in het bijzonder op de 17e en 22e met plaatselijk ruim 50 mm. Op 26 juni stond er langs de kust op sommige plaatsen enige tijd een stormachtige wind, kracht 8. Het aantal zonuren viel deze maand tegen. Gemiddeld over het land scheen de zon ca. 165 uren tegen 192 normaal. Vooral de laatste tien dagen van de maand verliepen somber. De zon scheen het meest in het noordwesten van het land. Opvallend somber was het in Zeeland. Westdorpe en Vlissingen waren met ca. 140, respectievelijk 145 zonuren de somberste KNMI-stations. In De Bilt scheen de zon ca. 170 uren tegen 187 normaal.